Одним из методов диагностики Babesia spp является полимеразно-цепная реакция в реальном времени (Real-time PCR). Этот метод позволяет выявлять наличие ДНК бабезий в образцах биологического материала пациентов. Для этого используются специфические праймеры и пробы, которые реагируют только на ДНК боррелий и позволяют выявить их наличие с высокой чувствительностью и специфичностью.